г. Москва, ул. Ленинская слобода, д. 19,
БЦ "Omega Plaza", 3й эт., оф. №3024-3

Новый стандарт ATCC упростит аутентификацию линий клеток человека

Опубликовано: 27.05.2021

Обновлено: 27.05.2021


  • Новый стандарт ATCC упростит аутентификацию линий клеток человека
Линии клеток человека – это иммортализованные (неизменные) клетки, размноженные в искусственных условиях (in vitro) из первичных эксплантатов человеческой ткани / жидкостей организма. 

Использование культур клеток человека в качестве модели для более сложных биологических систем является неотъемлемой частью молекулярной биологии и биомедицинских исследований. Исследования клеточных культур обеспечивают лучшее понимание генетической эволюции и помогают решать иные задачи. 

Исследователи способны создавать линии клеток человека собственными силами / покупать существующие культуры клеток у коммерческих поставщиков / получать материалы из некоммерческих банков клеток. 

С линиями клеток человека следует обращаться как с потенциально опасным биологическим материалом, если они предварительно не подвергались специальному тестированию на отсутствие патогенов, передающихся через кровь.

Упростить работу с линиями клеток человека должен свежий добровольный основанный на консенсусе стандарт от Американской коллекции типовых культур (American Type Culture Collection; ATCC). Данная некоммерческая организация занимается, помимо прочего, стандартизацией биоматериалов и биоресурсов, а также связанных с ними процедур и процессов.

Подробнее о профилировании с коротким тандемным повторением 

Получение представителями академических кругов понимания генетической карты человека благодаря завершению знакового проекта «Геном человека» (The Human Genome Project; HGP) в 2003 являлось одним из крупнейших достижений в истории науки. Генетика во многом определяет суть человека, и ее понимание способно помочь в борьбе с болезнями и иными биологическими проблемами.

Обладая относительно глубоким пониманием генетики, современные ученые способны использовать ряд методов быстрого выявления определенных закономерностей. Одним из подобных методов является профилирование с коротким тандемным повторением.

Короткое концевое (тандемное) повторение (англ. Short Tandem Repeat; STR) – это концевая нуклеотидная последовательность, в состав которой входят ди-, три- / тетрануклеотидные повторяющиеся элементы. 

Метод STR-профилирования предполагает использование области повторяющейся ДНК (например, GATA-GATA-GATA) в качестве генетических маркеров для идентификации человека / аутентификации клеточной линии человека (установление происхождения и идентичности клеточной линии). 

Короткие концевые повторения легко амплифицируются (под амплификацией в молекулярной биологии понимается процесс формирования дополнительных копий участков ДНК, содержащих определенные гены / сегменты структурного гетерохроматина). 

Амплификация происходит с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). Причем несколько STR-локусов можно исследовать одновременно при создании профиля ДНК, что позволяет однозначно идентифицировать (аутентифицировать) образцы линии клеток человека.

Инструмент под названием STR-профилирование важен при лечении ряда заболеваний человека, включая рак, при определении субстратов, которые станут использоваться в ходе производства вакцин, и при создании рекомбинантных белков для терапии. Гарантия правильной идентификации генетического материала, используемого в ходе подобных процессов, играет ключевую роль в достижении будущего успеха.

Хотя STR-профилирование является относительно простым методом, используемым достаточно давно, применение ошибочно идентифицированных генетических линий в исследованиях все еще является распространенной проблемой, приводя к необоснованным денежным тратам и потерям человеко-часов исследователями.

Подробнее о стандарте ATCC ASN-0002-2021 STR

Документ ATCC ASN-0002-2021 "Аутентификация линий клеток человека: стандартизация профилирования коротких тандемных повторов (STR)" содержит подробное описание процедуры идентификации и аутентификации линий клеток человека, позволяя заинтересованным сторонам избегать неоднозначностей при использовании STR-профилирования. 

Документ определяет методологию STR-профилирования, анализа данных, контроля качества данных, интерпретации результатов и реализации общедоступной базы данных с возможностью поиска. Стандарт ATCC ASN-0002-2021, помогая заинтересованным сторонам с аутентификацией, позволяет решать следующие задачи:
  • Подтверждение происхождения человека;
  • Оценка согласованности профилей между условно родственными изолятами клеток;
  • Сравнение с базой данных профиля;
  • Обнаружение «загрязнения ДНК человека» (межвидовое межклеточное загрязнение).
Сфера охвата свежего добровольного стандарта не включает межвидовую идентификацию существ, не являющихся людьми, что потребовало бы использования иного процесса генетической маркировки.

Стандарт ATCC ASN-0002-2021 дополнительно решает проблему неверно идентифицированных генетических линий в исследованиях, предоставляя историческую перспективу стандартизации аутентификации линий клеток человека посредством профилирования STR. Данный момент является крайне важным, поскольку сегодня ученые могут быть недостаточно осведомлены о прошлых открытиях, что приводит к дублированию работы или ошибкам.

Поделиться с друзьями!

Теги: линия клеток человека ATCC генетика медицина ATCC ASN-0002-2021 STR биоматериалы биоресурсы генетическая карта человека


Подписка
Оставьте ваш e-mail, чтобы получать новости